氨基酸分為蛋白類氨基酸和非蛋白類氨基酸。其中，蛋白類氨基酸參與蛋白分子合成，根據(jù)氨基在碳鏈上的位置不同，可以分為α、β、γ等氨基酸。構(gòu)成天然蛋白質(zhì)的氨基酸都是α型的，包括20種常見(jiàn)的氨基酸和2種不常見(jiàn)氨基酸。非蛋白類氨基酸就不能構(gòu)成蛋白，它需要經(jīng)過(guò)修飾才能參與蛋白的合成，比如瓜氨酸。目前，檢測(cè)氨基酸的方法有分光光度法、高效液相色譜法、氣相色譜法、紅外檢測(cè)、液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用法、毛細(xì)管電泳法等。

常見(jiàn)的氨基酸對(duì)可見(jiàn)光是沒(méi)有吸收能力的，在紫外光下有比較小的吸收。但是，絡(luò)氨酸、色氨酸和苯丙氨酸這3種氨基酸卻有很強(qiáng)的吸收能力。因?yàn)榇蠖鄶?shù)的蛋白質(zhì)都含有這3種氨基酸，尤其是絡(luò)氨酸相對(duì)普遍。因此在測(cè)定蛋白含量的時(shí)候，就以絡(luò)氨酸吸收的特征來(lái)測(cè)定。絡(luò)氨酸在280nm的波長(zhǎng)下，蛋白質(zhì)溶液吸光值和濃度成正比。除了蛋白質(zhì)的檢測(cè)，也可以單獨(dú)對(duì)每種氨基酸進(jìn)行測(cè)定。

高效液相色譜（HPLC）是檢測(cè)氨基酸的常用方法，以流動(dòng)相和色譜柱為分離，檢測(cè)靈敏度高。由于大多數(shù)的氨基酸沒(méi)有紫外或熒光反應(yīng)。因此，需要對(duì)樣品進(jìn)行衍生化處理，將它們轉(zhuǎn)變?yōu)槟軌蛲ㄟ^(guò)紫外吸收或發(fā)射熒光的物質(zhì)，再進(jìn)行上機(jī)檢測(cè)，可以有效的分離和檢測(cè)出各種氨基酸及其代謝物。

分光光度法，剛剛已經(jīng)說(shuō)了，氨基酸本身是沒(méi)有辦法通過(guò)紫外吸收檢測(cè)出來(lái)的。利用氨基酸和衍生劑發(fā)生化學(xué)反應(yīng)，產(chǎn)物藍(lán)紫色的化合物。這個(gè)化合物在某個(gè)波長(zhǎng)處能夠顯示最大的吸收峰，根據(jù)吸收值和濃度的關(guān)系，測(cè)定其含量。其中常用的衍生劑是茚三酮，使用分光光度法測(cè)定氨基酸是相對(duì)比較簡(jiǎn)單的，成本低，應(yīng)用范圍廣，甚至可以測(cè)芳香族氨基酸。